The Aftermath speelt zich af in het naoorlogse Duitsland in 1946. Rachael Morgan (Keira Knightley) arriveert in de ruïnes van Hamburg in de bittere winter, om herenigd te worden met haar man Lewis (Jason Clarke), een Britse kolonel die belast is met de wederopbouw van de verwoeste stad. Maar als ze op weg gaan naar hun nieuwe huis, ontdekt Rachael tot haar verbijstering dat Lewis een onverwachte beslissing heeft genomen: Ze delen het grote huis met de vorige eigenaars, een Duitse weduwnaar (Alexander Skarsgård) en zijn problematische dochter. In deze geladen sfeer maken vijandschap en verdriet plaats voor passie en verraad.