De wereld bevindt zich midden in de industriële revolutie wanneer gruwelijke wezens uit een mysterieus virus te voorschijn komen, die het vlees van mensen verscheuren om hun eindeloze honger te stillen. De enige manier om deze wezens, bekend als "Kabane", te doden is door hun met staal beklede harten te vernietigen. Als het slachtoffer echter door een van deze monsters wordt gebeten, is het gedoemd tot een lot dat erger is dan de dood, want de gevallenen staan weer op om zich bij hun mede-ondoden te voegen. Alleen de meest versterkte beschavingen hebben deze onrust overleefd, zoals het eiland Hinomoto, waar de mensheid een enorme muur heeft gebouwd om zich te beschermen tegen de eindeloze hordes Kabane. De enige toegang tot deze reusachtige forten is via zwaar gepantserde treinen, die worden onderhouden en gebouwd door jonge mannen als Ikoma. Ikoma heeft een dodelijk wapen gemaakt dat volgens hem gemakkelijk door de harten van de Kabane kan breken en hij wacht vol ongeduld op de dag waarop hij met zijn nieuwe uitvinding zal kunnen vechten. Hij weet echter niet dat zijn kans veel eerder komt dan hij had verwacht.