In een strijd tegen de klaxosaurussen zijn alleen de kinderen, die als parasieten worden beschouwd, de hoop van de mensheid in deze stervende wereld. Vechtend in gemechaniseerde pakken, bekend als FRANXX, worden de parasieten gegroepeerd in mannelijke en vrouwelijke paren om het op te nemen tegen de monsterlijke wezens. Hiro was ooit een FRANXX wonderkind piloot. Maar als hij de strijd opgeeft, ontmoet hij Nul Twee, het meisje met de hoorns, en vindt hij een nieuwe reden om door te gaan.