Na de onthutsende onthulling dat Raymond "Red" Reddington (James Spader) niet is wie hij zegt dat hij is, wordt Elizabeth Keen (Megan Boone) verscheurd tussen de relatie die ze heeft ontwikkeld met de man die beweert haar vader te zijn en haar verlangen om jaren van geheimen en leugens tot op de bodem uit te zoeken. Ondertussen leidt Red Liz en de FBI naar de meest vreemde en gevaarlijke criminelen tot nu toe, waarbij hij zijn imperium laat groeien en rivalen uitschakelt. Liz en Red zijn de hele tijd verwikkeld in een ongemakkelijk kat-en-muisspel waarin grenzen worden overschreden en de waarheid aan het licht komt.