In deze vierde en laatste film van de populaire franchise is Shrek (Mike Myers) niet alleen gelukkig getrouwd met prinses Fiona (Cameron Diaz), maar is hij ook een lieve, zorgzame vader voor zijn drieling. Terwijl zijn dorpsgenoten vroeger al schrokken bij het noemen van zijn naam, zijn ze nu niet meer bang voor hem. Wanneer Shrek zich realiseert dat hij tegenwoordig wordt gezien als goedzak, neemt hij contact op met de schalkse Repelsteeltje om zijn dorpsgenoten opnieuw de stuipen op het lijf te kunnen jagen. Door een onverwacht foutje komt hij echter terecht in een alternatieve versie van Ver Heel Ver van Hier, waarin Repelsteeltje koning is, Donkey wagens moet trekken en De Gelaarsde Kat liever lui is dan moet. Het ergste van alles? Shrek en Fiona hebben elkaar in deze wereld nog nooit ontmoet. Shrek moet nu zijn reputatie zien terug te krijgen als topoger in het dorp, maar daarnaast ook z'n grote liefde terugvinden.