Caesar (Andy Serkis) en zijn apen worden gedwongen tot een dodelijk conflict met een leger van mensen onder leiding van een meedogenloze kolonel (Woody Harrelson). Maar nadat de apen onvoorstelbare verliezen hebben geleden, worstelt Caesar met zijn duistere instincten en besluit hij zijn soort te wreken, waardoor hij het opneemt tegen de kolonel in een epische strijd die het lot van hun beide soorten zal bepalen... en de toekomst van de planeet.