Ash denkt misschien dat hij alles al heeft gezien op Pokémon-gebied, maar is hij klaar om het op te nemen tegen de mysterieuze Darkrai in zijn nieuwste geweldige avontuur? Op weg naar een Pokémon-wedstrijd komen onze avonturiers door Alamos Town, de thuisbasis van de Time-Space Tower. Samen met de mooie Alice ontdekken Ash en zijn vrienden dat er iets is dat verschrikkelijke nachtmerries veroorzaakt bij zowel Pokémon als mensen! Baron Alberto, een onstuimige maar arrogante kerel, geeft Darkrai onmiddellijk de schuld van deze gebeurtenissen. Alsof hij de beschuldiging net heeft gehoord, verschijnt Darkrai en confronteert onze helden! Wie is Darkrai? Is het een duivel of een vriend? Terwijl de hemel boven Alamos Town scheurt en Legendarische Pokémon Dialga en Palkia zich door de scheuren in een nieuw gecreëerde dimensie worstelen, dreigt hun gevecht een gat in het tijd-ruimtecontinuüm te slaan! Zullen Ash en zijn vrienden deze confrontatie overleven en Darkrai's ware aard leren kennen?